Compitió en Primera División hasta 2012, año en que pierde la categoría por primera vez. Tras igualar en el primer partido, cayó derrotado en el segundo encuentro, perdiendo la categoría por segunda vez. En 2001 se inscribe en la Primera B donde compite hasta 2004, temporada en la que gana el Torneo Reducido y obtiene el segundo ascenso a Primera División. En 2020 compitió en Primera B. Tras la suspensión del torneo original debido a la pandemia, equipacion atletico de madrid 2024 disputó el torneo transición donde superó la fase inicial.
