El 12 de agosto de 2017, el mediapunta mostoleño vio cumplido su sueño de marcar un gol con el Atlético de Madrid en un partido amistoso frente al CD Leganés que supuso la victoria del equipo de Diego Pablo Simeone. El 18 de septiembre de 2016, Juan anotó su primer gol, anotando el juego solo en un triunfo como local sobre el Rayo Vallecano B. Hizo su debut en el primer equipo el 30 de noviembre de 2016 a las órdenes de Diego Pablo Simeone, equipacion atletico de madrid 2022 reemplazando a su compañero debutante Caio Henrique en la victoria por 6-0 contra el CD Guijuelo en Copa del Rey.
