También el equipo juvenil descendió de manera contundente después de una única temporada, la 2002-03, en División de Honor. Una época curiosa hasta la llegada de KIA, equipacion atletico de madrid que fue el patrocinador más longevo en la camiseta rojiblanca desde los legendarios tiempos de Marbella. El trabajo de cantera que está desarrollando el Villarreal ya hace tiempo que viene dando sus frutos.